日本的博士课程学制通常为3年，但医学，牙医学，兽医学的博士课程学制通常为4年。博士课程申请者只限于具有硕士学位，或被承认具有同等学力者。日本的博士生分为两种，一种为课程博士，另一种为论文博士。课程博士生应取得30个以上的学分(包括在硕士课程中取得的学分)，考试合格并通过论文审查即可获得博士学位。论文博士可以不在学，根据学校的有关规定，通过博士论文审查，具有博士课程修了者同等以上学历，也可获得博士学位。博士课程第一学年平均缴费在80万日元到150万日元不等。从第二年度开始，由于不必缴付入学费，所以缴费大约可减少30%。日语教育机构一年收费在40万到100万日元之间，短期大学学费在55万到137万日元之间。